研究所定位于生命科学基础研究，在PI制的基础上，针对生物化学和细胞生物学主要前沿研究方向，围绕国家重点实验室和研究中心形成了三大研究集群，涵盖五大前沿领域 三大研究集群 分子生物学国家重点实验室细胞生物学国家重点实验室国家蛋白质科。

北京蛋白质组研究中心研究员，博士生导师从事肝脏相关的生理病学研究，重点是肝细胞生长调控的分子机制研究近年来主要进行肝脏蛋白质的相互作用研究发现并克隆一种能特异刺激肝源小生细胞增殖的新型细胞活性因子肝细胞生成。

现任军事医学科学院副院长研究员，北京蛋白质组研究中心主任，复旦大学生物医学研究院院长教授博士生导师2001年当选为中国科学院院士2005年当选为第三世界科学院院士主要从事基因组学蛋白质组学与生物信息学研究。

合作研究的领域覆盖了微生物病毒及高等生物线粒体全基因组及蛋白质组研究利用EST或SAGE技术对多个物种进行基因表达及转录组研究以及一些人类疾病相关基因的遗传连锁分析等其中与浙江大学浙江省农业科学院联合研究的“。

研究基因的表达调控机制，研究基因在生物体代谢途径中的地位，分析基因基因产物之间的相互作用关系，绘制基因调控网络图4比较基因组学研究，在基因组水平对各个生物进行对照比较，可以揭示生命的起源和进化发现蛋白质。

1从北京西站步行约180米，到达北京西站 2乘坐320区，经过10站， 到达国家图书馆站也可乘坐695特63乘坐运通205，经过29站， 到达生命科学园站 4步行约380米，到达北京蛋白质组研究中。

2个研究所分子生物学研究所，细胞生物学研究所，2个国家重点实验室蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室，生物膜及膜生物工程国家重点实验室，2个国家基地国家理科基地，国家生命科学与技术人才基地拥有5个。

首先用一个自动系统来提取人类细胞的蛋白质，继而用色谱仪进行部分分离，将每区段中的蛋白质裂解，再用质谱仪分析，并在蛋白质数据库中通过特征分析来认识产生的多肽 蛋白质组研究的另一个重要内容是建立蛋白质相互关系的目录生物大。